На данный момент, возможность выбора версии php есть на всех тарифах с поддержкой php. Версия помеченная как "native" работает в режиме модуля веб-сервера apache, все другие версии, без такой пометки, работают в режиме CGI. Режим CGI - более медленный ("на глаз" это незаметно, но на высоконагруженных проектах может вызвать проблемы) в отличие от работы модулем apache, и, желательно его не использовать - т.к. кроме разницы в быстродействии в нём нельзя, например, выставить переменные php через .htaccess и т.п.
Для выбора версии, перейдите в раздел заказов хостинга, биллинговой панели, и нажмите кнопку с "Управлять заказом" напротив нужного заказа:

В новой вкладке (или в новом окне, зависит от настроек вашего браузера - в любом случае, должны быть разрешены всплывающие окна) откроется панель управления сервером. В ней, переходим в раздел "WWW-домены":

Выделяем домен, для которого необходимо изменить версию php, нажимаем кнопку "Редактировать":

Выбираем режим работы интерпретатора php - для установки альтернативной версии необходим режим работы "CGI":

После этого, становится доступно поле с версией php, выбираем нужную - например, 5.2:

Сохраняем внесённые изменения:

Всё, сайт работает с нужной версией php. Если необходимо сделать какие-то настройки (включить какой-то модуль, или выставить какие-то переменные) то переходим в раздел "PHP":

Для примера, включим расширение tidy. Выбираем нужную версию php, нажимаем кнопку "Расширения":

Выбираем нужное расширение, нажимаем кнопку "Включить":

Запрашивается подтверждение - соглашаемся:

Значок напротив модуля изменился. Если навести на него мышку, отображается статус - включено:

Если вам необходимо изменить какие-то переменные php - вернёмся назад:

Выбираем нужную версию php, нажимаем кнопку "Основные":

Для примера, включим "register_globals":

Сохраняемся, готово.